紧急避孕药有时可引起一些轻度的副作用：例如恶心、呕吐、头痛、头昏、腹痛、乳房胀痛。这些副作用一般在24小时内消失。
紧急避孕药的上市无疑让这些人松了一口气。按药品说明书，一个月内只能使用一次紧急避孕药，但有些新婚夫妇却往往在一个月内使用两次，甚至更多次的紧急避孕药。对此，医学专家提醒大家，计划生育是夫妻间一项"系统、长期的工程"，不应寄希望于经常使用紧急避孕药，超量及频繁使用可能会给身体带来损害。
避孕药的主要作用，包括抑制排卵，并改变子宫颈黏液，使精子不易穿透，或使子宫腺体减少肝糖的制造，让囊胚不易存活，或是改变子宫和输卵管的活动方式，阻碍受精卵的运送。
而避孕药的副作用，则包括容易恶心、肠胃不适、头痛、乳房压痛、体重微增、神经紧张、情绪低潮、月经不来、皮肤易有褐斑和粉刺等现象。此外，避孕药也可能会造成癌症，如乳癌、子宫颈癌、肝脏腺瘤。
使用紧急避孕药的副作用和如何处理？
1.恶心：用紧急避孕的女性恶心发生率最高，约为50%；左炔诺孕酮次之，约为20%；米非司酮最低，约6%～7%。恶心一般持续不超过24小时。
2.呕吐：用Yuzpe法进行紧急避孕的妇女约有20%发生呕吐；左炔诺孕酮约5%；米非司酮约1%。与食物同时服用或睡觉前服药可以减少恶心、呕吐的发生率。如果在口服紧急避孕药后1小时内呕吐，应该尽快补服1次。
3.不规则子宫出血：有些女性用药后会有些X点滴出血，一般无须处理，但要让用药者了解此种情况，做好用药前后的咨询、宣教。
4.月经改变：多数妇女月经会按时来潮，也有一部分妇女月经提前或延迟。如果月经延迟一周，应该做尿妊娠试验，以明确是否是紧急避孕失败。
5.其他：乳房胀痛、头痛、头晕、乏力等，这些症状一般较轻微，持续时间不超过24小时。乳房胀痛、头痛严重者可用阿斯匹林或其他止痛药对症处理。
服用紧急避孕药，会影响月经周期，因而在随后的几个月中计算安全期会有所障碍。女性在此之后尽量使用效率高的避孕方法，不要再冒险。
